SysMics vise à fédérer la communauté NExT autour d’un objectif commun : anticiper l’émergence de la médecine systémique en co-développant 3 approches de criblage génomique à grande échelle : le séquençage de génomes de populations de patients, le profilage génomique sur cellules uniques et la méta-génomique appliquée au(x) microbiote(s).

À ce titre, SysMics regroupe la plupart des unités de recherche nantaises en sciences du numérique et en biologie-santé, la société Biofortis, le CIC de Nantes et le CHU de Nantes autour des mêmes objectifs : faciliter les investigations cliniques basées sur le séquençage de génomes humains, la génomique sur cellules uniques et l’analyse du microbiome.

Ce colloque a pour but de présenter des projets de recherche en lien avec ces thématiques.
CL09

Sysmics cluster

Programme du colloque

9h - 9h30 : Accueil des participants

9h30 - 9h45 : Mot d'accueil
Richard Redon, Institut du thorax, Nantes

9h45 - 10h30 : Computational single cell biology in health and disease
Manfred Claassen, Institute of Molecular Systems Biology, Zurich

10h30 - 11h00 : Constraint based modeling to integrate treatment response and gene expression profiles in Cancer case studies
Lokmane Chebouba, LS2N, Nantes

11h00 - 11h30 : Pause-café
 

SESSION COMMUNE AVEC LE COLLOQUE MIBIOGATE CL13

MiBioGate


11h30 - 12h15 : Microbiote et Barrières Biologiques : vers une science et médecine de précision
Jan-Pieter Konsman, INCIA - UMR 5287, Bordeaux

12h15 - 14h00 : Déjeuner

14h00 - 14h30 : Role of the non-coding region of the genome in cardiac disease susceptibility
Julien Barc, Institut du thorax, Nantes

14h30 - 15h15 : Hashing a cell : Efficient analysis of large scale single cell expression data
Debarka Sengupta, Sengupta Lab, Delhi

15h15 - 15h45 : Pause-café

15h45 - 16h15 : Functional genomics strategies to understand immune diseases
Jérémie Poschman, CRTI UMR1064, Nantes

16h15 - 17h00 : Integration of multiple single-cell data types reveals cellular heterogeneity
Carl Herrmann, Biomedical genomics group, University of Heidelberg
Invitation soutenue par le Projet L'HéMA-NEXT 

LHEMNA NEXT

Comité scientifique

  • Richard Redon, Institut du thorax
  • Jérémie Bourdon, LS2N
  • Laurent David, CRTI
  • Stéphane Minvielle, CRCINA
  • Michel Neunlist, TENS
  • Patricia Parnet, PhAN
  • Pierre-Antoine Gourraud, CIC Nantes
  • Antoine Magnan, CHU Nantes
  • Françoise Le Vacon, Biofortis Mérieux NutriSciences

Comité d'organisation

  • Audrey Bihouée, GenoBiRD
  • Stéphanie Bonnaud, GenoBiRD
  • Raluca Teusan, GenoBiRD