SysMics vise à fédérer la communauté NExT autour d’un objectif commun : anticiper l’émergence de la médecine systémique en co-développant 3 approches de criblage génomique à grande échelle : le séquençage de génomes de populations de patients, le profilage génomique sur cellules uniques et la méta-génomique appliquée au(x) microbiote(s).

À ce titre, SysMics regroupe la plupart des unités de recherche nantaises en sciences du numérique et en biologie-santé, la société Biofortis, le CIC de Nantes et le CHU de Nantes autour des mêmes objectifs : faciliter les investigations cliniques basées sur le séquençage de génomes humains, la génomique sur cellules uniques et l’analyse du microbiome.

Ce colloque a pour but de présenter des projets de recherche en lien avec ces thématiques.
CL09

Sysmics cluster

Programme prévisionnel du colloque

9h - 9h30 : Accueil des participants

9h30-9h45 : Mot d'accueil
Richard Redon, Institut du thorax UMR 1087, Nantes

9h45-10h30 : Computational single cell biology in health and disease
Manfred Claassen, Institute of Molecular Systems Biology, Zurich

10h30-11h00 : Constraint based modeling to integrate treatment response and gene expression profiles in Cancer case studies
Carito Guziolowski, LS2N, Nantes (Sous réserve)

11h00-11h30 : Pause café

11h30-12h15 : Microbiote et Barrières Biologiques : vers une science et médecine de précision
Jan-Pieter Konsman, INCIA - UMR 5287, Bordeaux

Session commune Mibiogate (CL13)
MiBioGate



12h15-13h45 : Déjeuner

13h45-14h30 : Orateur à confirmer

14h30-15h00 : Role of the non-coding region of the genome in cardiac disease susceptibility
Julien Barc, Institut du thorax UMR 1087, Nantes

15h00-15h45 : Hashing a cell: Efficient analysis of large scale single cell expression data
Debarka Sengupta, Sengupta Lab, Delhi

15h45-16h15 : Pause café

16h15-16h45 : Functional genomics strategies to understand immune diseases
Jérémie Poschman, CRTI UMR1064, Nantes

16h45-17h30 : Integration of multiple single-cell data types reveals cellular heterogeneity
Carl Herrmann, Health Data Science Unit, University Clinics Heidelberg
Invitation soutenue par le Projet L'HéMA-NEXT
lhemna next

Comité scientifique

  • Richard Redon, DR, ITX
  • Jérémie Bourdon, PR, LS2N
  • Laurent David, MCU-PH, CRTI
  • Stéphane Minvielle, DR, CRCINA
  • Michel Neunlist, DR, TENS
  • Patricia Parnet, DR, PhAN
  • Pierre-Antoine Gourraud, PU-PH, CIC Nantes
  • Antoine Magnan, PU-PH, CHU Nantes
  • Françoise Le Vacon, Biofortis Mérieux NutriSciences

Comité d'organisation

  • Audrey Bihouée, GénoBiRD
  • Stéphanie Bonnaud, GénoBiRD
  • Raluca Teusan, GenoBiRD